پس از استقرار دولت چهاردهم و آغاز به کار وزرا و چندین انتصاب در دولت، انتصاب معاون سیاسی وزارت کشور یکی از مهم ترین انتصابات باقی مانده به شمار می رود و به نظر می رسد علی باقری گزینه مطلوب معاونت سیاسی وزارت کشور باشد.
در پی شهادت حسین امیر عبداللهیان، علی باقری سرپرست وزارت امور خارجه شد.